Nyttige noter om epitop af immunogener
Nyttige noter om epitop af immunogener!
De fleste immunogener består af mange typer molekyler.
Imidlertid virker kun få af disse molekyler som immunogen. Selv inden for et enkelt immunogent molekyle er immunresponsen ikke rettet mod hele molekylet, men kun mod nogle få aminosyrerester i molekylet.
Sættet af aminosyrer, der genkendes af immunoglobulinet eller T-celle-receptoren (TCR) hedder en epitop (tidligere kaldet en antigen determinant). Et enkelt immunogent molekyle kan have en eller flere forskellige epitopper (figur 6.1).
Figur 6.1: Diagram for at vise tilstedeværelsen af forskellige epitoper i et antigen.
I dette diagram er tre forskellige epitoper vist i et antigen. Peptidepitoperne adskiller sig fra hinanden af aminosyresekvenser, og de adskiller sig følgelig i deres tredimensionelle struktur. Da epitoperne adskiller sig fra hinanden, adskiller antistofferne, der induceres mod epitoperne, også hinanden. Overfladeimmunoglobulinet (slg; B-celle-receptor) på en B-celle binder til en epitop, og bindingen forekommer mellem epitopaminosyrerne og de komplementære aminosyresekvenser i den hypervariable region af slg.
Aminosyreresterne af protein har tendens til at folde i kompakte masser. Det samlede foldemønster for hvert protein er stift. Så optager aminosyreresterne på overfladen af den foldede masse faste steder i forhold til hinanden. Røntgenkrystallogrammer har vist, at antistoffer kommer i kontakt med aminosyreresterne på overfladen af et proteinantigen. Antallet af aminosyrer, hvortil hver antistofkontakt varierer fra 3-20.
jeg. I mange tilfælde ligger alle aminosyrerester af en epitop lineært. Sådanne epitoper kaldes lineære (eller sekventielle) epitoper. Varmedaturation ændrer ikke positionerne af restene i en lineær epitop. Derfor, selv efter opvarmning, kombineres de lineære epitoper med deres tilsvarende antistoffer (figur 6.2).
ii. Mens nogle epitoper ikke dannes af lineære aminosyrer. På grund af aminosyresammens foldende karakter kommer aminosyrerne fra forskellige steder i kæden tættere på hinanden. En epitop kan dannes af aminosyrer fra forskellige dele af polypeptidkæden og ligger tæt på hinanden. Denne type epitop hedder konformationsepitop.
Aminosyreresterne, som udgør den konformationelle epitop, er langt fra hinanden i den primære aminosyresekvens, men placeres tæt på hinanden i den tertiære struktur. Når et protein med konformationsepitop opvarmes, forekommer denaturering af proteinkæden, og aminosyrekæden løsner den tredimensionelle foldning. Aminosyrerne, som dannede epitopen, adskilles fra hinanden på grund af varme og følgelig går epitopen tabt. Derfor kan antistofferne dannet imod konformationsepitopen ikke binde til det denaturerede antigen (figur 6.2).
