Nyttige noter om enzympapain og enzympepsin
Immunoglobuliner er proteiner og er generelt resistente over for fordøjelsen af enzymer.
Imidlertid spalter enzympapain og pepsin immunoglobulinmolekylerne. Fragmenterne, der genereres af papain og pepsin, er nyttige til undersøgelser af immunoglobulinstruktur og -funktioner. Men spaltningsstederne for disse to enzymer er forskellige (figur 9.5).
Figur 9.5: Skematisk diagram over proteolytisk fragmentering af immunoglobulin ved kort behandling med enzymer papain og pepsin.
Enzymapain spalter immunoglobulinet på den N-terminale side af den inter-tung-kæde disulfidbinding og producerer tre fragmenter (to Fab-fragmenter og et Fc-fragment). Enzympepsin spalter immunoglobulinet i den C-terminale region og producerer et stort fragment (som indeholder to Fab-regioner) kaldet F (ab ') 2 . De resterende tunge kæder på den C-terminale side fordøjes i flere små peptider
1. Enzym Papain:
Enzymapain spalter hængselsområdet på den N- terminale side af de inter-tunge kæde disulfider, og dette resulterer i dannelsen af tre fragmenter. (To fragmenter indeholdende den variable region og et fragment indeholdende CH2- og CH3 - regionerne). De to fragmenter indeholdende det variable område kaldes; Fab-fragmenter (dvs. fragment-antigen-binding), da de har antigenbindingsstederne.
Det tredje fragment omfatter de carboxyl-terminale dele af begge tunge kæder, der holdes sammen af disulfider. Generelt er strukturen af det tredje fragment identisk for mange forskellige immunglobulinmolekyler.
Derfor kan fragmenter af disse typer krystalliseres, selvom de består af mange forskellige immunglobuliner. Så kaldes dette fragment fragmentet krystalliserbart eller Fc fragment. De fleste af immunoglobulins sekundære biologiske egenskaber afhænger af sekvenserne i Fc-regionen. Også dette er regionen genkendt af Fc receptorer på mange celletyper.
2. Enzym Pepsin:
Enzympepsin spalter immunoglobulinet på den carboxyterminale side af hængselregionen, hvilket resulterer i et stort fragment kaldet F (ab ') 2 . F (ab ') 2 har to Fab-fragmenter forbundet med disulfidbindinger. Fc-regionen nedbrydes i vid udstrækning af pepsin, og normalt forbliver intet intakt Fc-fragment efter pepsinfordøjelse.
